El procedimiento es realizado en una sala especial con todas las condiciones de seguridad, privacidad y comodidad requeridas. Para el procedimiento de USE se usa un tubo delgado y flexible llamado endoscopio que lleva un dispositivo que permite obtener imágenes de ultrasonido al área que se examina dentro de su cuerpo. La sedación es colocada por especialista en Anestesiología, por lo tanto el paciente no experimenta dolor. El paciente se coloca de costado sobre su lado izquierdo con las rodillas dobladas hacia el tórax. Se inserta el ecoendoscopio realizando el estudio de la mucosa durante la entrada y salida del equipo.